- Vezető: Prof. Gáspári Zoltán
- Tagok: Dr. Péterfia Bálint, Dr. Dobson-Kálmán Zsófia, Nagy-Kanta Eszter, Sánta Anna, Farkas Fanni, Szabó András László, Varga Soma
- Kapcsolat: gaspari.zoltan@itk.ppke.hu
- A laboratórium kutatási témája a szinaptikus jelátvitelben részt vevő egyes fehérjék szerkezet-funkció összefüggéseinek vizsgálata kísérletes és számítógépes módszerekkel. A ún. posztszinaptikus denzitás (PSD) egy sűrű és dinamikusan átrendeződő fehérjehálózat, melynek fontos szerepe van a tanulás és a memória molekuláris szintű folyamataiban. A PSD létrejöttében fontos szerepe van a multivalens interakcióknak, amikor ugyanazon partnerek többféle helyen is kapcsolatot létesíthetnek egymással. Laboratóriumunkban a kísérletesen vizsgálni kívánt fehérjéket biotechnológiai úton állítjuk elő, majd különböző biofizikai módszerekkel jellemezzük azok szerkezetét, belső mozgásait és partnerkötési tulajdonságait. Mindemellett bioinformatikai és molekulamodellezési eljárásokkal vizsgáljuk mind egyes fehérjék működését, mind a posztszinaptikus denzitás fehérjehálózatának nagyobb léptékű szerveződését.
A PSD-95 fehérje PDZ1-PDZ2 tandem doménpárjának molekuladinamikai szimulációjáéból származó reprezentatív szerkezetek. A különböző klaszterekben más-más domén-domén interakciók dominálnak, összefüggésben a ligandum jelenlétével vagy hiányával is.
